De Universiteit van Franeker was tussen 1585-1811 een belangrijke universiteit in Franeker (Friesland, Nederland). Opvallend genoeg was het de op één na oudste universiteit van Nederland, opgericht kort na de Universiteit Leiden.
Het stond ook bekend als Academia Franekerensis of minder vaak als “de Universiteit van Friesland”. Op haar hoogtepunt had ze een aantal faculteiten of academische afdelingen, met name: Theologie, Rechten, Geneeskunde, Filosofie, Wiskunde en Natuurkunde.
Je kunt wel zeggen dat Peter Stuyvesant, de laatste directeur-generaal van de Nederlandse kolonie Nieuw-Nederland, een van haar bekende studenten was.
De universiteit had een uitstekende nationale en internationale reputatie en trok studenten van heinde en verre, maar werd in 1811 door Napoleon opgeheven, samen met de universiteiten van Harderwijk en Utrecht. Aan het einde van het Franse bewind werd de universiteit echter niet hersteld.
De historische en symbolische vlam van de universiteit werd pas in 2008 weer opgepakt met de oprichting van EUCLID als een intergouvernementele universiteit met een instituut dat aanvankelijk “Eurostate” werd genoemd vanwege de focus op Europese geschiedenis en bestuur. Het Eurostate University Institute werd daarna omgedoopt tot het Euler-Franeker Memorial University Institute en streeft ernaar om in haar academische principes de erfenis van de Universiteit van Franeker te integreren.
